黑水溝位於東吉嶼東邊的澎湖水道，主要受到地形、季風以及黑潮支流通過的影響，在此形成強勁的海流。由於受到黑潮支流的影響，四座島嶼附近海域海水溫暖，水流交換良好，海底大多數為適合珊瑚礁附著的堅硬玄武岩底質，造就了澎湖南方海域良好的珊瑚礁覆蓋率。 ※影片擷取自〈海角新樂園─澎湖南方四島〉/ 海洋國家公園管理處出版